Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fam43bA2AM80 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fam43bA2AM80 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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