Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Prdm12A2AJ77 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms