Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pramel3A2AHA7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms