Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Frmpd4A2AFR3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Frmpd4A2AFR3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms