Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Calcoco2A2A6M5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calcoco2A2A6M5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms