Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sppl2cA2A6C4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms