Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrp1bA1Z198 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrp1bA1Z198 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms