Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssc4dA1L0T3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms