Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
B020011L13RikA0A087WQI7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms