Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
C9orf135Q5VTT2 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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