Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
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SCN9AQ15858 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
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SCN9AQ15858 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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SCN9AQ15858 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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SCN9AQ15858 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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SCN9AQ15858 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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SCN9AQ15858 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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SCN9AQ15858 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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SCN9AQ15858 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SCN9AQ15858 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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