Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
RBBP4Q09028 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms