Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms