Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms