Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd1Q9Z2E2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms