Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shcbp1Q9Z179 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms