Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh20Q9Z0M3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh20Q9Z0M3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh20Q9Z0M3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh20Q9Z0M3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh20Q9Z0M3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh20Q9Z0M3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh20Q9Z0M3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh20Q9Z0M3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh20Q9Z0M3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh20Q9Z0M3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh20Q9Z0M3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdh20Q9Z0M3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh20Q9Z0M3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdh20Q9Z0M3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdh20Q9Z0M3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms