Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PapolbQ9WVP6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PapolbQ9WVP6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms