Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
VapaQ9WV55 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
VapaQ9WV55 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms