Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srd5a3Q9WUP4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srd5a3Q9WUP4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms