Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Scnn1bQ9WU38 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms