Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkraQ9WTX2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkraQ9WTX2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms