Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cdh13Q9WTR5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdh13Q9WTR5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cdh13Q9WTR5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cdh13Q9WTR5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdh13Q9WTR5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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