Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tubd1Q9R1K7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tubd1Q9R1K7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms