Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Plod3Q9R0E1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Plod3Q9R0E1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms