Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Plod2Q9R0B9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms