Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nek3Q9R0A5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nek3Q9R0A5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms