Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sh2d3cQ9QZS8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sh2d3cQ9QZS8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sh2d3cQ9QZS8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sh2d3cQ9QZS8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sh2d3cQ9QZS8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sh2d3cQ9QZS8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sh2d3cQ9QZS8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sh2d3cQ9QZS8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sh2d3cQ9QZS8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh2d3cQ9QZS8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms