Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms