Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Six6Q9QZ28 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Six6Q9QZ28 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms