Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Phtf1Q9QZ09 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Phtf1Q9QZ09 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms