Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VapbQ9QY76 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VapbQ9QY76 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms