Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Foxe3Q9QY14 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Foxe3Q9QY14 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms