Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nufip1Q9QXX8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nufip1Q9QXX8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms