Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc5Q9QX29 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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Trpc5Q9QX29 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trpc5Q9QX29 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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