Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SrfQ9JM73 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms