Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trpc4apQ9JLV2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trpc4apQ9JLV2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms