Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tgm1Q9JLF6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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