Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr10Q9JL21 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr10Q9JL21 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccr10Q9JL21 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr10Q9JL21 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr10Q9JL21 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr10Q9JL21 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr10Q9JL21 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr10Q9JL21 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr10Q9JL21 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr10Q9JL21 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr10Q9JL21 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccr10Q9JL21 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccr10Q9JL21 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms