Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX3

Tfr2, Transferrin receptor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfr2Q9JKX3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfr2Q9JKX3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfr2Q9JKX3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfr2Q9JKX3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfr2Q9JKX3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfr2Q9JKX3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfr2Q9JKX3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfr2Q9JKX3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfr2Q9JKX3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfr2Q9JKX3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms