Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp4Q9JKV5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms