Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
AtrQ9JKK8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms