Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cyp39a1Q9JKJ9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms