Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nectin1Q9JKF6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nectin1Q9JKF6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms