Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ercc6l2Q9JIM3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ercc6l2Q9JIM3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms