Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3bQ9JHJ5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3bQ9JHJ5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms