Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Capn12Q9ER56 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Capn12Q9ER56 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms