Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Clca3a2Q9EQR4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms