Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf8Q9EQH4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms