Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Mrpl4Q9DCU6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms